Противоречия вызваны тем, что система с формально различными задачами (МВД, СБУ, прокуратура, суд) действуют в одном правовом пространстве, и каждая из них неизбежно стремится «подмять» остальные.

Из всех систем только суд является наименее коррумпированным и наиболее непредвзятым. Связано это с тем, что судебное производство в большей степени соответствует общепринятым в мировой практике стандартам соблюдения прав человека, чем производство предварительного следствия, осуществляемое в остальных трех системах. Кроме этого, в судебной системе работают обычно достаточно квалифицированные профессионалы, т.к. по по законодательству судья должен отвечать определенным квалифицированным требованиям (наличие высшего юридического образования, стаж практической работы и т.д.), в отличие, например, от системы дознания и предварительного следствия.

Немаловажным фактором является и то, что процессуальная основа судебного разбирательства основана на принципе состязательности, т.е. равенства всех участников перед законом. Это значит, что и обвинитель (прокурор), и обвиняемый имеют равное право на доказывание, мотивированные отводы, ходатайства перед судом, в отличие от системы предварительного следствия, где обычно происходит «игра в одни ворота» и обвиняемый всецело зависит от доброй (или злой) воли следователя и прокурора.

Наконец, суд – единственное ведомство, объективно незаинтересованное в практических результатах уголовного дела, в отличие от МВД, СБУ и прокуратуры, имеющих в своем подчинении следственные органы.

Взаимодействие же существует в силу необходимости решения общих задач, как формального, так и неформального порядка (по несколько видоизмененному известному принципу: «ты решил мою проблему – я решу твою»).